バルト海はこうした工場から出る排水や、７０００万人の生活排水が流し込まれている。さらに寒冷地なので農業には大量の肥料が使われている。そして原料や製品を運ぶために海運も盛んで、大量の有機物や化学物質、重金属で汚染されている。この大量の有機物質のため、たびたび海水は酸素不足になり、タラやニシンなどのかつて豊富だった魚も年々減少しているという。

　バルト海周辺にある化学工場などの重金属の使用量は、年間、水銀＝６０トン、鉛＝１万４０００トン、銅＝２万７０００トン、亜鉛＝６万８０００トンに及ぶ。また、科学物質の量は年間推定で１４万トンに達している。バルト海は北海と比べると低温で海水はほとんど巡回しない。そのため１度海に入ってきた海水がバルト海を出るまでには２０〜３０年かかると言われている。したがって、汚染物質はバルト海の中に長期滞留し、蓄積されることになる。